kivantium活動日記

プログラムを使っていろいろやります

2016-08-01から1ヶ月間の記事一覧

精度保証付き数値計算(その1)

コンピュータ上で実数を表現する際には浮動小数点数を使うのですが、浮動小数点数の計算では誤差が発生します。簡単な例を見てみます。 #include <cstdio> int main(void) { float a = 0.0; for(int i=0; i<10000; ++i) a += 0.01; printf("%.10f\n", a); } という0.</cstdio>…

COBRApyを使ったFlux Balance Analysis

生物の代謝を数学的にシミュレーションする手法の一つにFlux balance analysis(FBA, 日本語だと「代謝流束均衡解析」)というものがあります。一般的な代謝のシミュレーションでは速度定数を実験的に求めてから微分方程式を解く必要があり、実験の手間も計…

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